Si se puede. Tienes 2 formas de instalarlo.
1.- Para mi la más recomendable, por si luego decides borrar Ubuntu. Desconecta el ssd y haces la instacion en el hdd, ten en cuenta que tendrás que crear varias particiones y que no serán visibles de forma nativa desde Windows. Cuando lo tengas instalado reinicias para terminar la configuración de Linux, apagas el ordenador y ya puedes conectar el ssd. Cuando enciendas el ordenador pulsas f8 o la tecla necesaria según la placa que tengas y eliges el disco duro desde el que quieres iniciar y listo.
2.- Este es un poco más complejo. Sin desconectar el ssd haces la instalación del Linux, ojo con las particiones y cuidado de no hacerlo en el ssd. Cuando haya terminado la instalación al reiniciar te aparecerá un pequeño menú, grub, en el cual podrás elegir si inicias Windows o Linux. Ten en cuenta que el grub puede instalarse en el ssd y que cuando borres Linux probablemente tendrás que volver a recuperar el inicio de Windows con el disco de instalación del propio Windows.
Como ves la opción 1 es la más sencilla por si algo sale mal.
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