ayuda para instalar ssd

Buenas noches, vereis, me acaba de llegar el ssd que pedi el black friday; segui los pasos y clone mi hhd.
Ahora en teoria los dos discos tienen lo mismo, lo siguiente supongo que es borrar según partes del hhd y del ssd, de manera que tenga lo mismo que antes entre los dos discos, pero no se los archivos de windows que debo dejar, la idea es tener el sistema operativo y programas que uso bastante en el ssd y el resto en hdd.
Pero no me aclaro, por ejemplo la carpeta users la borro en el hdd? Y una vez echo con los programas tengo que cambiar sus rutas por las nuevas? y si borro la carpeta users como pongo por defecto la carpeta users del ssd.

Gracias, ando bastante liado.

he dejado seleccionado el ssd en la bios para acceder siempre desde el, supongo que debo dejar en el hdd la carpeta de los programas y otra para archivos como peliculas y demas y ya como si fuera un pendrive verdad?