Si que se te va a reducir el rendimiento, además bastante.
El de x16 tiene más ancho de banda, más latencia y soporta mucha más carga de trabajo.
La de x1 se suele usar para adaptadores de red, tarjetas de sonido, tarjetas de expansión... Pero no están pensadas para gráficas.
Espero que te haya sido de ayuda.
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Nota 2: En comunidad la ayuda ha de ser reciproca, busca temas sin respuesta y participa