Hola !
Para esa configuración, yo me iría a gráficas de 2ª mano, ya que en la mayoría de los casos, no se aprovecharían las ventajas y la potencia de las gráficas actuales.
Algunas gráficas que irían bien en tu PC serían:
GTX 750, 760, 950, 960, 1050.
Ciertas GTX como la 670, 680, 770, 780 podrían ser interesantes si tienes una buena fuente de alimentación (consumen más).
En AMD también tienes opciones interesantes como Radeon 560 - 570 y muchas más.
Gddr 3 ó 5 se refiere al tipo de memoria que utiliza la gráfica. Cuánto mayor sea el número, es una generación superior y por lo tanto más rápida.
En cuanto al PCIe, igualmente se refiere a la generación y cuánto mayor sea el número mejor. No obstante, son retrocompatibles. Es decir, una gráfica PCIe x4 debería funcionar sin problemas en un puerto PCIe x2, eso sí, sin aprovechar todas las ventajas de la última generación.
También debería funcionar una gráfica PCIe x2 en un puerto PCIe x4.
Volviendo al tema de tu gráfica, si actualmente estás utilizando la gráfica integrada y le vas a poner una dedicada, tendrás un aumento de consumo y por lo tanto deberás asegurarte de que tu fuente de alimentación actual será capaz de soportarlo.
Espero haberte aclarado alguna de tus dudas.
Saludos.
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