No puedo clonar disco duro

Buenas,me ha llegado un disco duro nuevo para sustituir al ssd que estoy usando ahora y que está a punto de morir. he intentado clonarlo con varios programas y nada,me lo copia todo pero no lo hace booteable y no arranca el sistema.Hace unas semanas clone otro disco duro de otro pc con el cd booteable de acronis pero no se porque no me reconoce ningún disco,ni el ssd,ni el disco nuevo ni otro disco de 500gb.
Ayuda por favor.

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Cuando hagas la copia del disco debes marcar como partición activa la misma q tenga el disco de origen.

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¿A que te refieres?Me salen las dos activas(3 contando con el otro hdd) pero me sale boot solo en el ssd

No se porque me sale una partición que pone reservado para el sistema en el disco duro normal cuando el sistema está en el ssd...
Arranque sale también en el ssd.Cuando clono el disco no arranca,se queda en loading operating system y no pasa de esa pantalla.¿Alguna idea?El último programa que he usado a sido el Reflect

Tienes q clonar todas las particiones del hd al ssd tal cual estén.

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El ssd es el que está roto y tengo que quitar.Ahora mismo está puesto el ssd con el SO y otro disco de 500gb con el resto de cosas y una partición reservada de 100mb que no se que pinta en ese disco porque no es el que tiene el SO. Al clonar el contenido del ssd,el SO al hdd nuevo es cuando no arranca,se queda en loading operating system

Bueno, pues tienes q clonar todas las particiones del ssd al hdd tal y como están.
Prueba el acronis disk director o el Paragon partition manager (este no estoy seguro del nombre). Ambos vienen el el hirens boot (junto con un windows autoarrancable q facilita mucho todas estas operaciones).

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...Debo estar explicandome fatal.En el ssd que quiero quitar solo hay una partición,el SO.
La partición que no se que pinta es una que pone reservado para el sistema en un hdd normal que no quiero quitar y que tiene el resto de cosas que no son SO.
He clonado el ssd en el hdd nuevo y no hay manera,en cuanto quito el ssd e intento arrancar con el hdd que debería ser igual no arranca,se queda en loading operating system. He probado con distintos programas.El último intento ha sido con el hirens,arrancando desde USB y nada,más de lo mismo. He metido el cd de w7 y he intentado reparar inicio y tampoco va,sale un error¬¬

Ya funciona.No se como pero ya va bien.Lo único es que ahora me salen 3 discos en equipo.El hdd nuevo,el otro hdd donde tengo todos los programas y otro que sale reservado para el sistema.Tengo una partición que se llama reservado para el sistema en cada hdd y una me la muestra en equipo con una letra distinta a la unidad a la que pertenece,pa morirse vamos.No borro las particiones por miedo...