duda electrica sobre pc retro

Tengo un problema con una maquina industrial, para ser especifico, con el pc que incorpora, un i386dx para ser exactos, en una placa base sin nombre. Al grano, se ha estropeado la placa base, y estoy mirando para hacerme con una de segunda mano que es casi igual, pero no identica. Con lo que necesito ayuda es lo siguiente:

La fuente de alimentación es la integrada de la maquina, no puedo cambiarla, ni ponerle otra solo para el pc (ya se probó). El caso es que el conector es de 12 pines (las antiguas AT) pero tiene pinta que al hacer la maquina, solo tenian 8 cables y los adaptaron a un conector de 12 (adjunto foto de la chapuza), la cuestión es que después de medir los voltajes, son correctos y coinciden con lo que necesita una placa AT (los 4 que faltan son 2 tierra(negros), uno de 5v, y el de -5v) el ordenador lleva unos 25 años funcionando con esos conectores, pero no están en el orden correcto que ponen todos los diagramas que he encontrado, aun asi el ordenador arranca sin problema. Mi duda es si al coger una placa nueva, tengo que ponerlos en el orden correcto (con los 4 negros enmedio) o dejarlo como esta.

Seria de gran ayuda que me dierais consejo antes de cargarme una placa nueva.

un saludo