Si son gráficas iguales y el PC te reconocía ambas de salida creo que podemos descartar una avería de la nueva gráfica con casi total seguridad, intercambiarlas de sitio no cambiará nada.
Si el cable no está defectuoso (que eso no lo sabemos), las conexiones y la alimentación están correctamente conectadas, los drivers actualizados y la toma de vídeo en su sitio, ya se escapa de mis conocimientos...por probar puedes probar a conectarlo por VGA en vez de HDMI o conectar la toma de vídeo a la otra gráfica marcada como "(2)" (mientras no la hayas puesto a la placa cegado por la frustración
) o bien instalar el Nvidia Inspector a ver si añade alguna especificación para SLI que te falte en los drivers (creo recordar que solo hacía una descarga de perfiles pero a saber), a lo mejor es cualquier chorrada y la hemos pasado por alto.
¿Al final miraste la bios por si había alguna incompatibilidad con el típico icono "!"? (esto es importante). Si tienes GPU-Z comprueba si considera que el SLI está activado o no y si cada una de las GPUs tienen exactamente el mismo valor PCI-E en el campo "Bus interface" cuando están ambas conectadas, si no es así prueba ambas gráficas por separado en la ranura principal a ver si dan los mismos valores en ese campo.
Otra cosa, manda si puedes una foto de como lo has montado donde se vea lo mejor posible la placa madre con las gráficas puestas a ver si alguien más experimentado (o en su defecto yo) ve algo raro. Por cierto la foto que has puesto antes era de la Gaming 9 pero tu has escrito que tienes la 5 ¿es la 5 entonces?
Por probar más cosas...
¿Al quitar el puente de SLI te salta el mensaje emergente recomendando su uso? Si no es así algo raro pasa porque el SO no detecta la posibilidad de hacer SLI tal y como está ahora montado, luego algo no está en el sitio (digo yo).
¿Has visto en el panel de control de windows -no el de nvidia- si hay algún dispositivo dando problemas o mal conectado?
¿Tienes la posibilidad de hacer la prueba del SLI que te dije en otro equipo?
¿Puedes mirar a ver si en el panel de nvidia en "Configuración 3D\Ajustar la configuración de la imagen..." lo tienes puesto en "Utilice la Configuración 3D avanzada"?
¿Que versión de windows tienes?
¿El Feng-Shui de tu casa es bueno?
¿Sabes si en el terreno donde construyeron tu finca pudo haber un cementerio indio hace siglos?
Arf, arf...
Hmmm, sólo me queda preguntarte si no habrás paseado últimamente al anochecer por alguna ciénaga oscura y maloliente en algún paraje apartado y siniestro, donde ya no va ni el inserso (ya es difícil) y, a la luz de la luna llena teñida de rojo, has visto reclinada sobre una zanja, repleta de agua negra y estancada, a una señora mayor con los dientes puntiagudos y llena de verrugas, vestida de negro con harapos y bisutería rústica (con estética recurrente de calaveras y arañas), acompañada de un gato negro de mirada incómodamente humana y apoyada en una escoba con manchas (que parecen como de... ¿ketchup?) y tú, llevado por un impulso un poco macarrilla, le has dado una patada en el trasero y te has largado corriendo mientras la vieja, con más mier** encima que el dormitorio de un pavo, gritaba como una histérica en un idioma desconocido haciendo gestos extraños hacia tu persona. Si es así dilo que ya te presento a una zíngara que conozco y que visita a domicilio con carromato, oso amaestrado, violinistas melenudos y barbudos semejantes a Kusturika y toda la parafernalia e igual te quita el mal de ojo ;D