En la instalación del sistema operativo, te detectará los discos y tu eliges donde instalar.
Ventajas, separación lógica del disco, independencia entre los archivos personales y del sistema, más facilidad de recuperación de datos, mas tolerancia a fallos por parte del ordenador.
Desventajas? Una mala organización a la hora de particionar puede dejar espacios en el disco vacios, el sistema de arranque puede liarse si no especificas correctamente cuales son las particiones con sistemas y cuales son las que solo tienen datos.
En principio no hay muchas desventajas, no es algo especialmente dificil, con leerte un tutorial antes de hacerlo vas sobrado.
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